Eu já estava enjoado do problema de transparência do flash 9 para o Linux. Saí em busca de uma solução genérica e funcional. Acabei me surpreendendo quando vi que já liberaram versões beta do flash 10.
Segundo alguns colegas aqui do escritório da Conrad Caine, o flash player 10 virá com 3D nativo entre outras features. Acabei de instalar e fiquei satisfeito com o resultado. Problemas de transparência e problemas de disposição (As animações em flash ignoravam o z-index, ficavam sempre à frente de tudo) foram resolvidos.
Clique aqui para baixar a versão do flash player 10 para Linux, Mac, Windows e etc…